La mélatonine constitue probablement un traitement efficace contre la céphalée de cluster ou la migraine. Pour les autres types de céphalées, on dispose encore de trop peu de recherches pour tirer des conclusions pertinentes. La quantité optimale de mélatonine s’élève à environ 3 mg pour une migraine et 10 mg pour une céphalée de cluster, mais des doses plus élevées peuvent être plus efficaces. Selon une étude de cas, 30 mg de mélatonine ont été nécessaires pour traiter une hemicrania continua. En tout cas, de fortes doses (jusqu’à 100 mg) ne présentent pas de graves de danger pour la santé.

Le rôle du rythme biologique de 24h en cas de céphalée fait l’objet de recherches depuis les années septante. La mélatonine, en tant qu’hormone de la nuit, a donc été considérée comme une thérapie possible, mais le mécanisme précis de la mélatonine reste, au jour d’aujourd’hui, l’objet de spéculations. Les patients profitent probablement d’un meilleur sommeil grâce à la mélatonine et peut-être que cela suffit déjà pour éviter une crise de migraine. Le rayon d’action de la mélatonine s’étend cependant au-delà du rythme jour-nuit : la mélatonine agit en effet sur les intestins, elle a une action anti-inflammatoire et analgésique.

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