Les modifications hormonales de la femme influencent fréquemment l’évolution de la migraine. La prépondérance féminine de la migraine apparaît à la puberté. Près de 60% des femmes souffrent de crises migraineuses durant les règles. Pour moins de 10% des femmes, la migraine survient même exclusivement pendant la menstruation (migraine menstruelle vraie). Durant la grossesse, la migraine s’améliore ou disparaît chez 60 à 70% des femmes, particulièrement durant les 2e et 3e trimestres.

Les contraceptifs oraux peuvent améliorer ou, au contraire, aggraver la migraine.
La ménarche, les règles, la grossesse, la prise de contraceptifs oraux ou de traitements hormonaux de substitution peuvent déclencher ou modifier la fréquence et l'intensité des crises migraineuses. A la ménopause, la migraine ne s'améliore pas toujours, elle a même tendance à s'aggraver lors de la péri ménopause. Les crises ont la réputation d'être sévères, de longue durée et de traitement difficile